Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERFP50548 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERFP50548 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERFP50548 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ERFP50548 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERFP50548 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERFP50548 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERFP50548 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERFP50548 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERFP50548 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERFP50548 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERFP50548 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERFP50548 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERFP50548 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERFP50548 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERFP50548 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ERFP50548 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERFP50548 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERFP50548 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
ERFP50548 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERFP50548 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERFP50548 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERFP50548 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERFP50548 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERFP50548 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERFP50548 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERFP50548 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERFP50548 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERFP50548 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERFP50548 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ERFP50548 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ERFP50548 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERFP50548 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERFP50548 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ERFP50548 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERFP50548 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERFP50548 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERFP50548 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERFP50548 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ERFP50548 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERFP50548 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERFP50548 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERFP50548 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ERFP50548 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERFP50548 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERFP50548 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ERFP50548 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERFP50548 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERFP50548 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERFP50548 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ERFP50548 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ERFP50548 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ERFP50548 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ERFP50548 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ERFP50548 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ERFP50548 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ERFP50548 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ERFP50548 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ERFP50548 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ERFP50548 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ERFP50548 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ERFP50548 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ERFP50548 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ERFP50548 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ERFP50548 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ERFP50548 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ERFP50548 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ERFP50548 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ERFP50548 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ERFP50548 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ERFP50548 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ERFP50548 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ERFP50548 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ERFP50548 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ERFP50548 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ERFP50548 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ERFP50548 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ERFP50548 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ERFP50548 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ERFP50548 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERFP50548 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERFP50548 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERFP50548 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERFP50548 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERFP50548 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
ERFP50548 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
ERFP50548 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERFP50548 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERFP50548 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERFP50548 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERFP50548 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERFP50548 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERFP50548 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
ERFP50548 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
ERFP50548 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERFP50548 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERFP50548 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERFP50548 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERFP50548 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERFP50548 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms