Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit3W8DXL4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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