Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms