Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z309

Cib2, Calcium and integrin-binding family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib2Q9Z309 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms