Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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Hdac5Q9Z2V6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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Hdac5Q9Z2V6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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Hdac5Q9Z2V6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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Hdac5Q9Z2V6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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Hdac5Q9Z2V6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
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Hdac5Q9Z2V6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
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Hdac5Q9Z2V6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
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Hdac5Q9Z2V6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
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Hdac5Q9Z2V6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms