Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms