Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp5Q9Z2P8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms