Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms