Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms