Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms