Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X0

Ccl27, C-C motif chemokine 27, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl27Q9Z1X0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ccl27Q9Z1X0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl27Q9Z1X0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Ccl27Q9Z1X0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ccl27Q9Z1X0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ccl27Q9Z1X0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ccl27Q9Z1X0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccl27Q9Z1X0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccl27Q9Z1X0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl27Q9Z1X0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ccl27Q9Z1X0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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