Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms