Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog1Q9Z160 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog1Q9Z160 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog1Q9Z160 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog1Q9Z160 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog1Q9Z160 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog1Q9Z160 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog1Q9Z160 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog1Q9Z160 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog1Q9Z160 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog1Q9Z160 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog1Q9Z160 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog1Q9Z160 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog1Q9Z160 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog1Q9Z160 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog1Q9Z160 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog1Q9Z160 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog1Q9Z160 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog1Q9Z160 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog1Q9Z160 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog1Q9Z160 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog1Q9Z160 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog1Q9Z160 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog1Q9Z160 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog1Q9Z160 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog1Q9Z160 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog1Q9Z160 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog1Q9Z160 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog1Q9Z160 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog1Q9Z160 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog1Q9Z160 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog1Q9Z160 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog1Q9Z160 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog1Q9Z160 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog1Q9Z160 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog1Q9Z160 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog1Q9Z160 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms