Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmg20bQ9Z104 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Hmg20bQ9Z104 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Hmg20bQ9Z104 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Hmg20bQ9Z104 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Hmg20bQ9Z104 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Hmg20bQ9Z104 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
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Hmg20bQ9Z104 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmg20bQ9Z104 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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