Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0M3

Cdh20, Cadherin-20, mousemouse

Predictions only

Length 801 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh20Q9Z0M3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh20Q9Z0M3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cdh20Q9Z0M3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cdh20Q9Z0M3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cdh20Q9Z0M3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cdh20Q9Z0M3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdh20Q9Z0M3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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