Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Snx1Q9WV80 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms