Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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Pfdn5Q9WU28 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn5Q9WU28 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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