Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkraQ9WTX2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms