Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh13Q9WTR5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms