Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6cQ9WTM3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms