Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ5

Ramp1, Receptor activity-modifying protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ramp1Q9WTJ5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ramp1Q9WTJ5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms