Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms