Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms