Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NrkQ9R0G8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms