Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms