Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS3

Numb, Protein numb homolog, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumbQ9QZS3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NumbQ9QZS3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NumbQ9QZS3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NumbQ9QZS3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NumbQ9QZS3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NumbQ9QZS3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NumbQ9QZS3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NumbQ9QZS3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NumbQ9QZS3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NumbQ9QZS3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NumbQ9QZS3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NumbQ9QZS3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.4 ms