Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf4Q9QZS2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms