Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms