Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps29Q9QZ88 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms