Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms