Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms