Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxe3Q9QY14 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms