Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms