Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms