Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chaf1aQ9QWF0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms