Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms