Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms