Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms