Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI0

Rhoa, Transforming protein RhoA, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoaQ9QUI0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhoaQ9QUI0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhoaQ9QUI0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms