Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
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