Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cabp1Q9JLK7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms