Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms