Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Tmod4Q9JLH8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Tmod4Q9JLH8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Tmod4Q9JLH8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Tmod4Q9JLH8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Tmod4Q9JLH8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Tmod4Q9JLH8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Tmod4Q9JLH8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Tmod4Q9JLH8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Tmod4Q9JLH8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
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Tmod4Q9JLH8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmod4Q9JLH8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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