Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsmQ9JL96 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms