Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms