Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb3Q9JKS4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms