Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms