Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms