Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms