Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Tmod2Q9JKK7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Tmod2Q9JKK7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Tmod2Q9JKK7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Tmod2Q9JKK7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Tmod2Q9JKK7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Tmod2Q9JKK7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Tmod2Q9JKK7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Tmod2Q9JKK7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Tmod2Q9JKK7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Tmod2Q9JKK7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmod2Q9JKK7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmod2Q9JKK7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmod2Q9JKK7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmod2Q9JKK7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmod2Q9JKK7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmod2Q9JKK7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmod2Q9JKK7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmod2Q9JKK7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmod2Q9JKK7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmod2Q9JKK7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmod2Q9JKK7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmod2Q9JKK7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms